Indien im 19. Jahrhundert. Die kleine Mary Lennox wird durch eine Choleraepidemie plötzlich zur Waise. Ihr einziger lebender Verwandter ist ihr buckliger Onkel Archibald Craven, und so wird Mary zu ihm nach Großbritannien gebracht, auf sein Anwesen in den Yorkshire Moors. Anfangs unhöflich und unangenehm im Umgang, beginnt Mary sich allmählich zum Besseren zu verändern, während sie heranwächst, das Anwesen erkundet und einige der Bediensteten kennenlernt, insbesondere das Dienstmädchen Martha und den Gärtner Ben Weatherstaff.
Mit Hilfe eines schlauen Rotkehlchens entdeckt Mary einen geheimnisvollen, gut verschlossenen Garten auf dem Anwesen. Unerwartet findet sie auch ihre Cousine in der Villa, von deren Existenz sie nie etwas geahnt hatte. Daraufhin beginnt sie, grandiose Pläne zu schmieden, die ihre Cousine, den Garten und letztendlich sich selbst verändern werden.
In 19th-century India, little Mary Lennox is suddenly orphaned by cholera. Her only living relative is her crook-backed uncle, Archibald Craven, so Mary is sent to live at his estate on the Yorkshire moors. Rude and unpleasant, Mary gradually begins to change as she explores the manor and grows to know some of the servants, particularly her maid Martha, and Ben Weatherstaff the gardener. With the help of a robin, Mary discovers a secret garden. She also discovers a cousin she never knew she had, and begins to form plans that transform her cousin, the garden, and ultimately herself.